研究建成小鼠腸道微生物資源庫

1月7日，《自然-通訊》發(fā)表了中國科學(xué)家完成的小鼠腸道微生物資源庫工作。

腸道微生物是近年來生命科學(xué)和健康領(lǐng)域研究的前沿和熱點(diǎn)。越來越多的證據(jù)表明，腸道微生物與宿主健康和生長發(fā)育密切相關(guān)，在未來人體健康管理和醫(yī)療產(chǎn)業(yè)發(fā)展中，具有十分重要的作用。腸道微生物資源庫的建設(shè)，是開發(fā)利用腸道微生物的基礎(chǔ)，是認(rèn)知宿主—微生物互作機(jī)制和開發(fā)微生物藥物的關(guān)鍵。

此次報(bào)道的小鼠腸道微生物資源庫包括126種微生物及其基因組。其中77種微生物是*成功分離培養(yǎng)的新物種，并對其進(jìn)行了分類學(xué)鑒定和命名，這些新物種的發(fā)現(xiàn)和鑒定，大幅度提高了對于小鼠腸道菌群高通量16SrRNA擴(kuò)增子測序數(shù)據(jù)的物種注釋比例。該小鼠菌株資源庫覆蓋了超過88%小鼠腸道的核心屬，其基因組代表了超過52%的小鼠腸道微生物的非冗余功能基因集。該資源庫的構(gòu)建使得可培養(yǎng)的小鼠腸道微生物菌株資源從48個(gè)屬增加到110個(gè)屬、從76種增加到180種，為后續(xù)基于小鼠模型開展腸道菌-宿主互作機(jī)理研究和功能菌株開發(fā)奠定了資源基礎(chǔ)。研究人員前期利用該資源庫中的一株狄氏副擬桿菌開展了腸道菌群與宿主互作的研究，發(fā)現(xiàn)狄氏副擬桿菌通過產(chǎn)生琥珀酸、次級膽酸來激活不同的信號通路，發(fā)揮多靶點(diǎn)整體調(diào)節(jié)作用，是一種潛在的、新型抗代謝綜合征益生菌(Wangetal.2019.CellRep.)。

該項(xiàng)工作由中國科學(xué)院微生物研究所博士劉暢等人完成，研究員劉雙江和劉宏偉為文章通訊作者。該項(xiàng)工作歷時(shí)二年多，得到了中科院微生物組計(jì)劃項(xiàng)目和國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目的支持。